Эксперты заявили, что Казахстан может столкнуться с дефицитом важных препаратов и ростом цен на лекарства как минимум на 5–7%.

 С начала 2026 года фармацевтический рынок Казахстана погрузился в состояние неопределенности. Введение НДС на лекарства и медизделия, которое должно было пополнить бюджет, на практике оборачивается возможным их дефицитом, из-за сложности налогового администрирования.

Реформа налогообложения в фармсекторе, вступившая в силу 1 января 2026 года, кардинально изменила правила ценообразования. Если раньше лекарства, медизделия и медуслуги освобождались от налога на добавленную стоимость, то теперь отрасль столкнулась с неоднородной системой ставок:

• 5% на лекарства с перспективой роста до 10% в 2027-м;
•  5% на медизделия;
• 16% на медизделия, не включенных в Перечень лекарств и медизделий, комплектующих медиизделий и технических вспомогательных (компенсаторных) средств, применяемого к размеру облагаемого оборота по реализации и импорта;
• 16% на импорт сырья, оборудования, комплектующих и материалов для производства лекарств и медизделий;
• Освобождение от НДС на лекарства, орфанных препаратов и медуслуг в рамках ГОБМП/ОСМС.

Но благие намерения законодателей разбились о суровую реальность администрирования. Как выяснилось на совещании, проведенном на площадке НПП «Атамекен» при участии Минздрава и Комитета госдоходов Минфина, не все подзаконные акты до сих пор утверждены.

По словам заместителя председателя Комитета медицинского и фармацевтического контроля Минздрава Гаухар Раймкуловой, на сегодняшний день постановление с перечнями освобождаемых от НДС лекарств, орфанных препаратов и медуслуг в рамках ГОБМП и ОСМС утверждено. Но постановление о налогообложении лекарственных средств и медицинских изделий при реализации и импорте находится на согласовании в Аппарате Правительства РК. Также на доработке находятся правила формирования предельных цен на лекарства и медизделия, где предусматривается внесение изменений в части формирования предельных цен на лекарственные средства без учета НДС.

Предприниматели отмечают наличие затруднений при определении отпускных цен на лекарственные средства в связи с отсутствием утверждённых правил формирования предельных цен на лекарства и медизделия. В результате участники цепочки поставок приостанавливают реализацию продукции: производители дистрибьюторам, дистрибьюторы — в адрес аптек.

«Комитет госдоходов Минфина не осуществляет регулирование предельных цен на лекарственные средства, в связи с чем исчисление НДС производится исходя из цены реализации продукции. Для урегулирования вопросов ценообразования Комитет медицинского и фармацевтического контроля Минздрава должен утвердить правила формирования предельных цен на лекарства и медизделия с соответствующими изменениями. При этом субъекты, применяющие специальный налоговый режим на основе упрощённой декларации, реализуют продукцию без НДС, что формирует экономическую нецелесообразность их взаимодействия с плательщиками НДС» - сообщил заместитель председателя Комитета госдоходов Жаныбек Нуржанов.

В ходе совещания участники также обсудили вопрос отсутствия возможности при импорте лекарств предоставить договор поставки в рамках госзаказа, поскольку тендерные процедуры нередко проводятся после ввоза продукции. В результате при импорте готовых лекарств и фармацевтических субстанций у импортёров отсутствует возможность заранее определить объёмы, предназначенные для госзаказа и для коммерческого сегмента.

"Освобождение от НДС в рамках ГОБМП/ОСМС применяется при ввозе лекарств только при наличии соответствующего договора. В случае если при ввозе лекарств НДС был уплачен, последующее освобождение от НДС не применяется, обратного возврата НДС не предусмотрено, при этом освобождение распространяется исключительно по перечню утвержденного Правительством РК и согласно имеющегося договора в рамках госзаказа" - прокомментировал Жаныбек Нуржанов.

По итогам совещания была достигнута договоренность о:

- направлении Комитетом медицинского и фармацевтического контроля Минздрава в адрес НПП «Атамекен» до внесения соответствующих изменений в правила формирования предельных цен на лекарства и медизделия разъяснительного письма о формировании предельных цен на лекарства без включения НДС (с отнесением НДС сверх предельной цены на лекарства);

- проведении отдельного совещания по администрированию налогообложения медицинских организаций и лабораторий с участием Минздрава, Комитета госходоходов, Фонда социального и медицинского страхования;

- повторном вынесении на уровень руководства Минздрава, Правительства РК вопроса о необходимости пересмотра подходов по налогообложению сектора здравоохранения.